SEKWENCJONOWANIE GENOMOWE (NEXT-GENERATION SEQUENCING)
Wychodząc naprzeciw szybko rosnącemu zainteresowaniu wysokoprzepustowym
sekwencjonowaniem genomowym (Next-Generation
Sequencing) firma CLC bio wprowadziła na rynek
oprogramowanie dedykowane do analizy
danych NGS.

Oprogramowanie to powstało we współpracy z
najważniejszymi dostawcami sekwenatorów nowej
generacji, takimi jak 454 Systems (Roche), Illumina,
Helicos czy Applied Biosystems.

Poniżej znajduje się krótka charakterystyka wybranych
produktów z dziedziny sekwencjonowanie genomowego:

  • CLC Genomics Workbench
    Przyjazne dla użytkownika środowisko do zaawansowanej analizy danych genomowych, transkryptomowych oraz epigenomowych. Oprogramowanie obsługuje formaty danych dostarczane przez sekwenatory 454 (Roche), SOLiD (ABI), Illumina, Helicos i inne.
  • CLC NGS Cell
    Oprogramowanie do wysoko wydajnej analizy danych z sekwencjonowania, nie posiadające graficznego interfejsu użytkownika.
  • CLC Genomics Server
    Trójwarstwowe rozwiązanie serwerowe umożliwiające bezpieczną, wydajną i elastyczną analizę danych z sekwencjonowania genomowego.
  • CLC Bioinformatics Database
    Oprogramowanie do bezpiecznego przechowywania i zarządzania danymi bioinformatycznymi


Przykładowe zastosowania standardowych oraz niestandardowych rozwiązań oferowanych przez CLC bio to:
  • Składanie sekwencji genomów przez porównanie (Reference assembly)
  • Składanie sekwencji de novo
  • Wykrywanie polimorfizmu SNP i DIP
  • Analiza epigenomiczna (immunoprecypitacja chromatyny, ChIP Seq)
  • Rekonstrukcja genów z sekwencji EST (Expressed Sequence Tags)  i cDNA
Aby przeczytać więcej na temat technologii sekwencjonowania genomowego (Next-Generation Sequencing), zapraszamy na stronę www.clcngs.com


Więcej informacji