CLC - specjalistyczne rozwiązanie bioinformatyczne

 

  • CLC bio posiada rekomendację najważniejszych producentów aparatury sekwencjonującej (Roche, Illumina, ABI, Helicos) co stanowi gwarancję oferowania oprogramowania i usług na najwyższym poziomie
  • CLC bio opracowała jeden z najlepszych na świecie algorytmów składania sekwencji DNA, dostosowany zarówno do krótkich (kilkadziesiąt nukleotydów) jak i długich odczytów (kilkaset nukleotydów)
  • Intuicyjny i spójny interfejs graficzny umożliwia szybką i przejrzystą analizę nawet bardzo długich sekwencji oraz łatwą wymianę danych pomiędzy użytkownikami różnych rozwiązań (w tym darmowego CLC Sequence Viewer)
  • Duża ilość narzędzi i algorytmów bioinformatycznych  zebrana w jednym miejscu zapewnia znaczne skrócenie czasu pracy
  • Funkcjonalność rozwiązań możne zostać dowolnie zmieniona poprzez samodzielne tworzenie nowych wtyczek (plug-in)
  • Oprogramowanie obsługuje wszystkie formaty danych stosowane w analizie sekwencji, dzięki czemu możliwy jest bezpośredni import odczytów z aparatury badawczej (w tym 454 Systems, Illumina, ABI oraz Helicos)
  • Dzięki pełnej integracji modułów możliwe jest stworzenie pełnego systemu informatycznego o architekturze klient-serwer-baza danych
  • Czasochłonne analizy można wykonywać w trybie wysoko-wydajnych obliczeń (HPC) dzięki command-linowym aplikacjom. Procesy takie jak składanie sekwencji DNA, analiza i dopasowanie sekwencji metodami HMMER, ClustalW czy Smitha-Watermana, wykonywane są nawet kilkaset razy szybciej.
  • CLC bio od początku współpracuje z wieloma akademickimi ośrodkami naukowo-badawczymi na całym świecie, dzięki czemu może zapewnić użytkownikom
  • Oprogramowanie CLC bio jest regularnie uaktualniane